MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori HUP-B14 plasmid pHPB14

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017734	CGCTT	2	10	35	44	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017734	GTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017734	T	6	6	152	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017734	ATT	2	6	203	208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017734	T	6	6	212	217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017734	GTTG	2	8	225	232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017734	TGGT	2	8	287	294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017734	GT	3	6	293	298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017734	T	6	6	330	335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017734	CTT	2	6	347	352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017734	T	6	6	398	403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017734	GTTT	2	8	425	432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017734	T	6	6	489	494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017734	TCT	2	6	532	537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017734	TTG	2	6	643	648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745518
16	NC_017734	T	6	6	698	703	0 %	100 %	0 %	0 %	386745518
17	NC_017734	TTAG	2	8	927	934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017734	CAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745519
19	NC_017734	ATG	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745519
20	NC_017734	ATG	2	6	1271	1276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745519
21	NC_017734	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745519
22	NC_017734	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	386745519
23	NC_017734	TCA	2	6	1409	1414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745519
24	NC_017734	CAAG	2	8	1485	1492	50 %	0 %	25 %	25 %	386745519
25	NC_017734	TGAT	2	8	1511	1518	25 %	50 %	25 %	0 %	386745519
26	NC_017734	T	7	7	1553	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	386745519
27	NC_017734	CTTC	2	8	1616	1623	0 %	50 %	0 %	50 %	386745519
28	NC_017734	ATTTG	2	10	1647	1656	20 %	60 %	20 %	0 %	386745519
29	NC_017734	TTCT	2	8	1688	1695	0 %	75 %	0 %	25 %	386745519
30	NC_017734	GCAT	2	8	1728	1735	25 %	25 %	25 %	25 %	386745519
31	NC_017734	TTC	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745520
32	NC_017734	TTA	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745520
33	NC_017734	ATG	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745520
34	NC_017734	T	6	6	2029	2034	0 %	100 %	0 %	0 %	386745520
35	NC_017734	AACA	2	8	2050	2057	75 %	0 %	0 %	25 %	386745520
36	NC_017734	TTG	2	6	2078	2083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
37	NC_017734	CGT	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745520
38	NC_017734	TTG	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
39	NC_017734	CTT	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745520
40	NC_017734	TTG	2	6	2332	2337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
41	NC_017734	TTCT	2	8	2413	2420	0 %	75 %	0 %	25 %	386745520
42	NC_017734	AAG	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745520
43	NC_017734	TTG	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
44	NC_017734	CT	3	6	2818	2823	0 %	50 %	0 %	50 %	386745520
45	NC_017734	AAT	2	6	2824	2829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745520
46	NC_017734	CAC	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386745520
47	NC_017734	TGT	2	6	2850	2855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
48	NC_017734	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	386745520
49	NC_017734	AAT	2	6	2879	2884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745520
50	NC_017734	TTA	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745520
51	NC_017734	GTT	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
52	NC_017734	GGT	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745520
53	NC_017734	GGT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745520
54	NC_017734	TTG	2	6	3129	3134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
55	NC_017734	TTTTTC	2	12	3142	3153	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386745520
56	NC_017734	TA	3	6	3232	3237	50 %	50 %	0 %	0 %	386745520
57	NC_017734	T	6	6	3246	3251	0 %	100 %	0 %	0 %	386745520
58	NC_017734	GT	3	6	3285	3290	0 %	50 %	50 %	0 %	386745520
59	NC_017734	TTC	2	6	3295	3300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745520
60	NC_017734	TAA	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386745520
61	NC_017734	TAATTC	2	12	3313	3324	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386745520
62	NC_017734	GTT	2	6	3336	3341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745520
63	NC_017734	TTA	2	6	3451	3456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017734	ACT	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017734	CCT	2	6	3536	3541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017734	TAA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017734	AAG	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017734	AAG	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017734	AAG	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017734	AAG	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017734	AAG	2	6	3779	3784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017734	A	6	6	3807	3812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017734	CG	4	8	3865	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017734	A	6	6	3891	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017734	AAACAA	2	12	3919	3930	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017734	T	6	6	3975	3980	0 %	100 %	0 %	0 %	386745521
77	NC_017734	CGCTT	2	10	4091	4100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017734	CGCTT	2	10	4157	4166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017734	GTT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017734	T	6	6	4274	4279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017734	ATT	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017734	T	6	6	4334	4339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017734	GTTG	2	8	4347	4354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017734	TGGT	2	8	4409	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017734	GT	3	6	4415	4420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017734	T	6	6	4452	4457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017734	CTT	2	6	4469	4474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017734	T	6	6	4520	4525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017734	GTTT	2	8	4547	4554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017734	T	6	6	4611	4616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017734	TCT	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017734	TTG	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745522
93	NC_017734	T	6	6	4820	4825	0 %	100 %	0 %	0 %	386745522
94	NC_017734	TTAG	2	8	5049	5056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017734	CAA	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386745523
96	NC_017734	ATG	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745523
97	NC_017734	ATG	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745523
98	NC_017734	TTG	2	6	5475	5480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745523
99	NC_017734	T	6	6	5509	5514	0 %	100 %	0 %	0 %	386745523
100	NC_017734	TCA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386745523
101	NC_017734	CAAG	2	8	5607	5614	50 %	0 %	25 %	25 %	386745523
102	NC_017734	TGAT	2	8	5633	5640	25 %	50 %	25 %	0 %	386745523
103	NC_017734	T	7	7	5675	5681	0 %	100 %	0 %	0 %	386745523
104	NC_017734	CTTC	2	8	5738	5745	0 %	50 %	0 %	50 %	386745523
105	NC_017734	ATTTG	2	10	5769	5778	20 %	60 %	20 %	0 %	386745523
106	NC_017734	TTCT	2	8	5810	5817	0 %	75 %	0 %	25 %	386745523
107	NC_017734	GCAT	2	8	5850	5857	25 %	25 %	25 %	25 %	386745523
108	NC_017734	TTC	2	6	5891	5896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745524
109	NC_017734	TTA	2	6	6050	6055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745524
110	NC_017734	ATG	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386745524
111	NC_017734	T	6	6	6151	6156	0 %	100 %	0 %	0 %	386745524
112	NC_017734	AACA	2	8	6172	6179	75 %	0 %	0 %	25 %	386745524
113	NC_017734	TTG	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
114	NC_017734	CGT	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386745524
115	NC_017734	TTG	2	6	6302	6307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
116	NC_017734	CTT	2	6	6374	6379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745524
117	NC_017734	TTG	2	6	6454	6459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
118	NC_017734	TTCT	2	8	6535	6542	0 %	75 %	0 %	25 %	386745524
119	NC_017734	AAG	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386745524
120	NC_017734	TTG	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
121	NC_017734	T	7	7	6902	6908	0 %	100 %	0 %	0 %	386745524
122	NC_017734	TTTTA	2	10	6967	6976	20 %	80 %	0 %	0 %	386745524
123	NC_017734	TTA	2	6	7151	7156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745524
124	NC_017734	GTT	2	6	7159	7164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
125	NC_017734	GGT	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745524
126	NC_017734	GGT	2	6	7228	7233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386745524
127	NC_017734	TTG	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
128	NC_017734	TTC	2	6	7282	7287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386745524
129	NC_017734	T	6	6	7288	7293	0 %	100 %	0 %	0 %	386745524
130	NC_017734	ATT	2	6	7322	7327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386745524
131	NC_017734	TTG	2	6	7340	7345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386745524
132	NC_017734	GT	3	6	7398	7403	0 %	50 %	50 %	0 %	386745524
133	NC_017734	TAA	2	6	7490	7495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017734	CCT	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017734	CT	3	6	7651	7656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017734	TCC	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017734	CAAGT	2	10	7680	7689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017734	TAT	2	6	7799	7804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017734	ACA	2	6	7828	7833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017734	GA	3	6	7871	7876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017734	T	6	6	7877	7882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017734	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017734	AAG	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017734	AAG	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017734	AAG	2	6	7961	7966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017734	A	6	6	7989	7994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017734	CG	4	8	8047	8054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017734	A	6	6	8073	8078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017734	AAACAA	2	12	8101	8112	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_017734	T	6	6	8157	8162	0 %	100 %	0 %	0 %	386745525
151	NC_017734	CGCTT	2	10	8273	8282	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.